具體方法介紹
1引水換水
通過周期性的引水、換水，稀釋水中營養鹽和有機物濃度，防止藻類瘋長，改善水質。我國的西湖引水工程日取水30萬m。，定期將錢塘江水引入西湖，在一定程度上控制了西湖水體惡化的趨勢。使用這種方法必須有充足的干凈水源作保證，成本較高。
2水體曝氣充氧
利用自然跌水(瀑布、噴泉等)或人工曝氣對水體復氧，促進上下層水體的混合，使水體保持好氧狀態，抑制底泥氮、磷的釋放，防止水體黑臭。羅固源等圜研究表明，曝氣對藻類生長有抑制作用，夜間曝氣的抑制作用尤其顯著。近年來在北京、上海等城市進行了一定規模的河道人工曝氣復氧試驗和工程實踐，取得了較好的效果。曝氣充氧動力能耗高，且難以實現根本的脫氮除磷，因此只能作為輔助治理手段。
3底泥疏浚
底泥疏浚是解決內源污染的重要措施，通過底泥的疏挖去除沉積物中的營養鹽和其他污染物，減少其向水體的釋放。美國、日本、瑞典等國都進行過底泥疏浚的試驗研究和工程實踐。杭州西湖經兩次大規模疏浚后，與富營養化相關的主要指標均有不同程度的改善，浮游動物種類增加，浮游植物生物量和藍藻比例均有所降低。底泥疏浚的缺點在于工程量較大，效果難以持久，可能破壞原有的底棲生物群落，挖出的污泥易造成二次污染。
4底泥原位處理
包括底泥封閉、底泥鈍化技術，主要是用塑料薄膜、顆粒材料覆蓋底泥，或者往水體投加鋁鹽、石灰等鈍化劑，阻隔、抑制底泥中氮、磷營養元素和重金屬的釋放，從而降低水體中營養鹽濃度。德國的Dagow湖和Globsow湖用硝酸鹽和鐵復合物進行底泥處理試驗，處理前磷釋放量4~6mg/(m•d)，處理后幾乎無釋
放。底泥原位處理技術容易對水底的生態系統造成破壞，難以保證效果的持久性，受風浪及水流擾動影響較大，工程應用不多。
5機械除藻
利用撈藻船、吸藻泵等機械設備捕撈水面上的藻類，間接去除水體氮、磷營養鹽。中科院水生生物研究所于2001-2002年對滇池水華藍藻進行機械清除，共清除藍藻360.83t(干重)，相當于從水體中去除了氮37.33t、磷2.71t、有機質200.32t，水體中的重金屬也被部分去除。機械除藻技術的優點是能夠快速應付藻類的大面積爆發，操作簡單，沒有負面效應，但只是一種應急補救措施。
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