無錫監測中心站完成微囊藻科研項目
江蘇省無錫市環境監測中心站片狀微囊藻基因組科研項目日前完成。目前片狀微囊藻已經順利進入中科院淡水藻種庫,極大地提升了無錫市環境監測中心站的生物監測能力,以及中心站在生物監測領域內和藍藻水華領域內的研究地位。
據了解,中心站這一項目的完成填補了國內片狀微囊藻研究領域內的空白,更新了國內微囊藻屬的系統分類。微囊藻Microcystis作為太湖藍藻水華的主要種類,探索其形態分類和生理特征對藍藻水華監測和藍藻水華的暴發機制研究均有重大意義。
據了解,2010年以來,無錫市環境監測中心站對太湖微囊藻水華進行了深入的系統分類學研究。片狀微囊藻(Microcystispanniformis)于2011年8月首次在太湖發現,經鑒定為微囊藻屬Microcystis在中國的一個新紀錄種。
隨后,項目組在藻株純培養和DNA提取上克服困難,最終完成這一科研課題。
片狀微囊藻基因組完成圖的獲得,其藻株純培養是關鍵,因為雜菌會嚴重影響到基因組最后的拼接。
2013年12月,課題組共培養了3批次的片狀微囊藻,但是均因雜菌過多,未能進行下一步實驗。最后課題組修改了藻株的培養方案。2014年4月,片狀微囊藻純培養實驗經過多方案和反復擴大培養,課題組最終較好地克服了雜菌干擾的技術難題。隨后,結合前期的廣泛調研,最終在12家實力雄厚的測序公司中,確定了合適的測序委托單位。
藻類高質量DNA的提取是課題組面臨的另一挑戰。課題組相繼嘗試了多種提取方法,最終在2014年11月初獲得了符合建庫條件的DNA。
2015年1月開始,課題組進一步整合東南大學和中科院水生所的科研資源,并隨后成功拼出片狀微囊藻的基因組完成圖,從而成為國內第一個、國際上第二個獲得Microcystis基因組完成圖的單位。

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